左庑向西为文楼，右庑向东为武楼。
奉天殿后为华盖殿，再向后是谨身殿，殿旁东有后左门，西有后右门。
以奉天殿、华盖殿、谨身殿三座大殿，构成了宫城的主体部分。
往北过乾清门即进入宫城的后廷部分，后廷南面正中的大门为乾清门，门外左右各有金狮一座，乾清门内为乾清宫大殿。
宫殿左边有日精门，右边有月华门，殿的东西有斜廊，廊后左边有东暖阁，右边有西暖阁。乾清宫后为坤宁宫，坤宁宫东、西两侧为东六宫、春和殿和西六宫、柔仪殿、西宫。
此外，宫城内还有大本堂，位于柔仪殿旁的奉先殿，位于奉天门之东的文渊阁，位于后宫西北角的御花园，位于坤宁宫后的内花园，以及一座不算太小的“动物园”。南京宫殿上的所有坊额、匾额，据称统一由詹希源手书。宫城城墙的城砖，早期由军工夫在应天府当地烧造，后来在改筑宫城时使用了一些其他地方烧造的城砖。
中央一级官署，基本安置于皇城洪武门内千步廊的两侧。从南向北来看，千步廊东侧为工部、兵部、礼部、户部、吏部、宗人府，千步廊西侧为太常寺、后军都督府、前军都督府、右军都督府、左军都督府、中军都督府，基本按照文左武右的格局。
《东隋国京城图志·序》称之为“六卿居左，经纬以文，五府处西，镇静以武。”
千步廊后，东侧置有东城兵马司、太医院、詹事府、翰林院；西侧置有钦天监，其测候台设在鸡笼山、旗手卫、锦衣卫、通政司。
在中央官署六部中，只有刑部没有设在洪武门内。
刑部、都察院和大理寺并称“三法司”，设置在太平门外的太平堤西侧。
据称“三法司门往北一带，旧有大墙，总括三法司、京畿道在内。”
这里的“大墙”虽不能与宫城、皇城、京城以及外郭城墙相比，但其耗用的建材和民工，相当可观。
当时朝廷全面负责南京建造的机构是工部，且作为其要的任务。
具体负责皇城建造工程的单位是营缮所，仍归工部管辖。
该项所位于通济门大街上。朱元璋自“旧内”迁入“新宫”后，原来居住的元御史大夫宅成为应天府署的所在地。
其他相当数量的中央及地方官署，散布皇城的各个地方。
在建造殿堂坛庙时，用心良苦，建造极为讲究。
以祭祀的坛庙为例，先后建造、改建过的主要祭祀坛庙有
圜丘、方丘、天地坛，社坛、稷坛、社稷坛，太庙、帝王庙、功臣庙等，约二十多座散步于京城各处。
最集中建造的庙宇是在鸡笼山南边山脚下的祭庙，共建有十二座庙。
除帝王庙和功臣庙外，分别是真武庙、蒋忠烈庙、都城隍庙、祠山广惠王庙、汉寿亭侯庙、五显灵顺庙、卞忠贞公庙、刘中肃王庙、卫国中肃公庙、曹武惠王庙等，统称“十庙”。
集中排列在鸡鸣山下的祭庙和所祭祀的对象已远远出了一般庙宇的功能。
皇城内部建造的坛庙不仅于此，在金川门外设置的龙江坛、定淮门外设置的晏公庙、神策门外设置的无祀鬼神庙、狮子山上设置的徐将军庙等等数不胜数。
三孔城门中门为皇帝的御道，只走帝后銮驾，左右侧门只有皇族、公、侯、驸马、文官三品和武官四品以上的官员才准许出入，其他品级只能走两阙门入，两掖门出。
午门除了是官员出入之门外，还是传达圣旨及朝廷告书的地方，也是皇帝处罚大臣“廷杖”之地。
午门之名因“以位当子午”而得名。
午门是天子所居的南门，级别高于宫城诸门，平面呈“凹”字形，上有面阔九间、进深五间的的城楼，象征皇权的“九五之尊”。
城楼两边有重檐崇楼两座，和左右两侧阙台上的另两座崇楼以及午城楼合称为“五凤楼”。
下有三孔城门，内门设闸一道，中门拱券高，左右有两阙，上有阙楼，下有阙门。
基座为石质须弥座，弥座上下均有勒腰，中间为方胜、卷云等纹饰的浅浮雕。
午门现存城台一座，须弥座和券门均保存完好，城门五孔，左右两阙于城门两侧有新建的登城道，城台顶保留百余座宽大的石础，城门的底部有青石雕刻而成的须弥座，上有精美的纹饰，简约大气，精美的缠枝如意纹须弥座代表了明初最高规格的建筑风格，永久的影响了后来的风格，风格完全被其他午门所继承。
内五龙桥是五座并列单孔拱券式汉白玉石拱桥，位于奉天门前广场内御河上。
内五龙桥正中的一座御路桥供皇帝专用，御路桥东西两侧为王公桥，供皇室成员、亲王大臣通行，再两侧为品级桥，供三品以上官员行走。
功能与承天门前的外五龙桥一致。
三大殿的主体，即金銮殿，是皇帝举行重大典礼和接受文武百官朝贺的地方，后来北京故宫的太和、中和、保和三殿就是模仿南京故宫奉天、华盖、谨身三殿而建。
奉天之名意为“奉天命而统天下”。
奉天殿坐落于三台之上，面阔十一间，进深五间，重檐庑殿顶，上盖琉璃金瓦，双檐重脊，雕梁画栋，朱漆描金雕花的门窗！
夏旭也只能看到这么远，因为他被暂时安排到钦天监！
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