接着神农洞，四人救下了桫椤树仙，桫椤树仙带他们回了梭罗树洞，桫椤树仙有两个，当初神农创造梭罗树的时候没想到会有两个树仙，四人救的是妹妹，妹妹让姐姐告知梭罗树结果的方法，姐姐本不愿意，但最后耐不住妹妹的软磨硬泡，还是说了。四人前往神农洞更深处，拿到了炙炎石，妹妹得到之后就立即开启了成仙仪式，但是没想到没成，烟消云散了，而姐姐也一样，姐姐离开前告知了一切，梭罗树只能结一个果实，所以只能成仙一个，但是成仙有个条件，就是不能有私心，妹妹虽然启动了成仙的仪式，但是存在私心，所以烟消云散。
最后一个是巢湖，四人去巢湖遇到了槐米，就是女萝岩在紫英剑下幸存的小妖怪，他们跑到这里来生活了。
槐米和紫英双方一见面就剑拔弩张，紫英想除掉它们，但是被云天河拦住，紫英一气之下离开了此地。在槐米等妖的帮助下，几人顺利拿到了鲲鳞，有了三神器，玄霄准备破冰而出了，玄霄让云天河他们先出去，怕破冰的时候伤到他们，还让他把望舒剑留下，云天河照做了。
结果，等到云天河再次去禁地找玄霄的时候，却被告知他们已经被从琼华派除名了。夙瑶还让他们尽快下山，韩菱纱不服，和夙瑶理论，夙瑶则搬出当年云天青和夙玉拿着望舒剑出逃的往事，云天河等人大惊，但是也只能接受结果。
结果没想到，几人还没来得及离开，柳梦璃又出事儿了，玄霄和夙瑶再次用双剑束缚妖界，导致柳梦璃的记忆觉醒，突然想起了当年的往事，原来柳梦璃本来就是幻冥界的妖，她找到云天河，告别之后就回了幻冥界。云天河听得一脸懵，连忙和韩菱纱去找柳梦璃，结果被妖界结界攻击，要不是慕容紫英帮忙，他差点就受伤了。
三人聚在一起商议，决定去问问青阳重光两位长老，长老告知，如果有鬼界的翳影枝，就能穿越大部分的结界，想必幻冥界也不是问题。三人便动身前往寻找，经过不周山的时候遇到了魔剑，这魔剑就是仙剑三里的那一把，紫英把魔剑收进了剑匣。后来又遇到了神龙，神龙召唤出自己五百年修为的幻影和三人打了一架，又给了云天河神龙之息，然后打开了鬼界通道，放他们进鬼界了。
三人进了鬼界，韩菱纱挥她大盗的功夫，偷到了翳影枝，本来准备就此离开，但韩菱纱从鬼差口中听说了转轮镜台可以见到没投胎的亲人，于是几人又前往转轮镜台。韩菱纱想见伯父，但是没见到，云天河倒是见到了云天青，云天河告知了前往琼华派一事，又问了一下当年的往事，结果现和夙玉描述的一样，只不过云天青夙玉之所以会拿着望舒剑离开，并不是因为想当坏人，而是因为面对琼华派为了成仙，随意屠杀幻冥界的生灵，实在是看不下去了，这才带着救下的小妖怪（也就是柳梦璃）逃离了琼华派。
原来柳梦璃真的是妖，几人也是挺震惊，这时，紫英说你既然是琼华派的人，怎么会救妖？云天青说，那如果下辈子你投胎做了妖呢？紫英觉得他说的有道理，这一次，他再次怀疑夙瑶教育他的，妖都是坏的这个想法不一定对了。
恰好此时鬼界现转轮镜台无缘无故在运转，派人来查看情况，而一只鸟受朋友所托，提前来提醒他们让他们快跑。逃走后，问那个小鬼差为什么帮他们，小鬼差说他和夏书生的那个傻女儿莲宝是好朋友，她六世都想陪在夏书生旁边。他们帮了莲宝，所以才帮他们。三人这才知道，莲宝是夏书生死去妻子的转世。
三人坐上了出去鬼界的船，韩菱纱感觉摆渡的人很熟悉，于是上前一看，竟然是她大伯。她大伯告知，韩家因为盗墓的原因，所以寿命被鬼界减少了，不仅如此，死后还要在鬼界服苦役。韩菱纱这才知道为什么族人寿命不长的原因，于是决定出去后就告知族人别去盗墓了。
出了鬼界，来到了酆都，这里有个支线，韩菱纱遇到了蜀山派的一个弟子，蜀山派弟子见她身体比较弱，就治疗了一下。在这之前，青阳重光也给了韩菱纱一个宝物，红魄，因为他俩知道韩菱纱是望舒剑宿主，羲和望舒本就相生相克，使用的时候必须要一起，不然就会受到反噬。而每次使用望舒剑的时候，韩菱纱都没在羲和剑旁边，自然得不到羲和剑的阳之力保护而受到望舒剑阴之力的反噬。
韩菱纱想再最后一次下墓，去封神陵，云天河、慕容紫英本来不同意，但是最后在韩菱纱的保证下，还是去了。韩菱纱既然知道了盗墓会折寿，为什么还去？因为她祖父当年就是因为去了封神陵才会神志不清。所以她想知道里面到底是什么情况，而她心里也清楚，封神陵里有一把神弓--后羿射日弓。
他们一路过关斩将，最终还是见到了后羿射日神弓，但就在韩菱纱触碰的那一刻，一道庄严的声音想起，神将句芒让韩菱纱放下神弓，原因是她盗墓有罪。并且双方打了一架，三人肯定打不过，但句芒还是留手了，并说因为韩菱纱并非私心，所以不收她的魂魄，众人才知道韩菱纱祖父当年为什么会神志不清，因为魂魄缺失。句芒收回了神弓，韩菱纱说是不是三世清白就可以拿神弓，句芒说是，于是韩菱纱让云天河去拿神弓。句芒问云天河，是否要拿神弓，云天河因为句芒打伤了韩菱纱就不太想要，但是韩菱纱还是强迫他必须要，天河最后还是说要。句芒给了云天河，并告诉他，等他死了，后羿射日弓就会回到封神陵。
拿到神弓后，他们去了琼华派，进入了幻冥界，一进去就遇到守卫，打了一架，又来了守卫，又差点打架，突然柳梦璃来了，告诉了守卫他们是朋友。三人在柳梦璃的带领下见到了幻冥界的主人，幻冥界主人告知了当年的一切，几人觉得琼华派的做法太残忍了，结果还没悲伤多久，琼华派就打破幻冥界的结界冲进来了。三人选择帮助幻冥界，结果途中有人偷袭紫英，怀朔为了救他被杀死了。几人出了幻冥界，现玄霄就在外面，他们已经得到足够的紫水晶了，就准备放开幻冥界，并且玄霄把水灵珠给了云天河，或许是觉得愧疚吧。
玄霄他们离去的时候，云天河想偷袭夙瑶夺取望舒剑，但是没打得过玄霄。云天河准备再来一次，柳梦璃拉住了他，因为幻冥界就要挣脱束缚了，他再去就不一定回得了幻冥界了，于是只能作罢。
四人回到幻冥界后，得知柳梦璃即将继承幻冥界之主的位置，此生都得守护幻冥界，也就是说很难离开。幻冥界之主幻化出了一个柳梦璃的虚影，陪伴三人。在三人见证柳梦璃接任幻冥界之主的位置后，幻冥界之主就让他们离开了。
三人商议以后又去找青阳重光，结果现玄霄噶了重光，因为重光想抢望舒剑。从这里可以看出，其实青阳重光也不是坏人，他们也觉得琼华派的做法不太好，而且使用多了望舒剑，韩菱纱的身体就越差，他们真的觉得这对于韩菱纱不公平。
但是奈何？
青阳告知，当年铸剑成功的时候，宗炼有一本手记，可能记载有救人的办法。但是手记早给了云天青，于是三人又回青鸾峰寻找，结果没找到，后来慕容紫英说会不会在墓室？结果韩菱纱拿出一个本子，当时进入墓室的时候，她偷了灵光藻玉和手记，但是偷灵光藻玉的时候被云天河现并要回去了。只有手记在自己手里，但是看不懂。紫英一看，确实是宗炼的手记，但是研究完后却现，一旦宿主激活望舒剑，除非死了，不然没有取消的办法。所以目前唯一能救韩菱纱的办法，只有夺回望舒剑。
于是三人带着柳梦璃的幻影又去琼华夺回望舒剑，结果没打得过玄霄，眼看琼华派就要到昆仑天光处，却不料又生一变，九天玄女出现，阻止了飞升，把此次飞升的琼华派弟子全部打入东海囚禁五百年。云天河、慕容紫英、韩菱纱三人虽然是琼华派弟子，但是他们是在阻止玄霄，所以免罪。
玄霄不服，但是没打得过九天玄女，最后一怒之下入了魔，九天玄女害怕了，准备上告天帝，对玄霄的处罚另外商议后再决定。
琼华派的建筑即将坠下，下界的百姓在劫难逃，天界不准备管，云天河觉得不公，九天玄女只说了一句“天意如此。”
只有玄霄，告诉云天河，他手中的后羿射日神弓，或许能救山下的百姓，后来云天河用双眼失明的后果，救下了山下的百姓。
最后的结局是，一百年后的一天，柳梦璃的分身逐渐消失，真身出现，以下是对话。
紫英：……你来了。
柳梦璃：紫英……。这些年，过得可好？
紫英：……无所谓好或不好，人生一场虚空大梦，韶花白转瞬即逝，惟有天道恒在，往复循环，不曾更改……
紫：你……他们等你很久了，一定有许多话要说，我先回剑冢……
柳梦璃转身看去，看到了两座墓，一座墓的木头做的墓碑上写着“爱妻韩菱纱之墓。”柳梦璃上前悲伤地抚摸。这时候，小木屋门开了，柳梦璃抬头看去，是云天河。
内心话，仙剑的故事大部分都是悲伤的，前面的几部没有哪一部的女主角能有个好结尾，仙剑一赵灵儿和水魔兽同归于尽，仙剑二苏媚不知去向，仙剑三龙葵和雪见必须牺牲一个，仙剑四韩菱纱早逝，仙剑五媳妇儿和父亲只能救一个，仙剑六还好，都没死，仙剑七女主没事儿。
不周山上，神龙给了云天河神龙之息，云天河活了一百多岁，还是年轻时的模样，慕容紫英都白飘飘了。